摘要: 目的用限制性标记基因组扫描(RLGS)分析前列腺腺癌基因组CpG岛的异常甲基化,为前列腺腺癌相关基因的甲基
化研究奠定基础。方法采用激光捕获显微切割技术从20 例前列腺腺癌和18 例良性前列腺增生组织中捕获均一同质的腺
体细胞,提取DNA,利用RLGS技术对这些样本基因组CpG岛扫描,比较前列腺腺癌和良性前列腺增生的CpG岛甲基化差
异,筛选出参与前列腺腺癌发生的CpG岛甲基化基因。将其上传至DAVID数据库进行GO分析,并对筛选出甲基化最显著
的基因DPYS进行焦磷酸测序。结果前列腺腺癌和良性前列腺增生分别有10245 个和8658 个CpG岛发生甲基化,甲基化
发生率分别为37.2%和30.3%,其中超过60%为启动子区CpG岛。前列腺腺癌与良性前列腺增生存在差异甲基化的CpG岛
有735个,其中高甲基化458个,去甲基化256个。筛选出DPYS、P16、APC、GSTP1、TMEM122、RARB、ARHGAP20等7个前列腺
腺癌甲基化最显著的基因。生物信息学分析提示这些基因涉及多个分子功能和生物过程,其中DPYS参与了13 个GO注释
的生物功能,50种疾病的发生发展和47个蛋白间的相互作用。对CpG岛7个位点进行焦磷酸测序,平均甲基化频率为32.7%。可
能在前列腺腺癌发生发展中存在重要的意义。结论RLGS发现前列腺腺癌和良性前列腺增生之间存在大量CpG岛高甲基
化和去甲基化改变。筛选出甲基化显著的基因DPYS在前列腺腺癌发生和发展中起重要作用,机制有待进一步研究。