南方医科大学学报 ›› 2021, Vol. 41 ›› Issue (11): 1725-1732.doi: 10.12122/j.issn.1673-4254.2021.11.19
徐 丽,刘姗姗,王 敏,刘 芳,张容秀,张 凯
XU Li, LIU Shanshan, WANG Min, LIU Fang, ZHANG Rongxiu, ZHANG Kai
摘要: 目的 分析 srn821798 对变链素Ⅳ的影响,探索变链素Ⅳ转录后的规律。方法 用靶基因预测软件 RNAhybrid、RNAPredator和IntaRNA对srn821798进行靶基因预测,继而采用抑菌圈实验筛选了高表达变链素Ⅳ的变异链球菌菌株和不表达变链素Ⅳ的变异链球菌菌株各10株,并采用qPCR技术检测了这些菌株中srn821798和候选靶基因的表达水平。体外合成srn821798模拟物和抑制剂,采用电转化的方法在变异链球菌UA159标准株中构建了srn821798高表达株和低表达株,分析和比较这些菌株中srn821798和候选靶基因的表达水平。最后通过电泳和双荧光素酶报告基因实验检测了srn821798和候选靶基因sepM预测作用位点的结合能力。采用SPSS20.0软件包对数据进行统计学分析。结果 变异链球菌临床菌株中高表达变链素Ⅳ组中的候选靶基因sepM,comD,comE,nlmA及nlmB的表达水平均显著高于无表达变链素Ⅳ组,而高表达变链素Ⅳ组srn821798的表达水平显著低于无表达变链素Ⅳ组(P<0.05)。虽然标准株中srn821798上调组和下调组中候选靶基因的表达水平差异不大,但 sepM 的表达水平存在差异分布的趋势,并且预测的 srn821798 与 sepM 作用位点的结合能力较高。结论 srn821798可能在变链素Ⅳ的形成中起着一定的调控作用,但机制有待进一步探索。