摘要: 目的探讨环状RNA(circRNA)在Luminal亚型乳腺癌细胞与正常乳腺细胞中表达谱的差异。方法分别提取Luminal亚 型细胞MCF7和正常乳腺细胞MCF10A的总RNA;使用NanoDrop ND-1000对total RNA质量进行检测,用核糖核酸酶R分解 total RNA以除去线性RNA并富集circRNA;利用随机引物法扩增富集的circRNA并转录成荧光cRNA;将荧光标记cRNA杂交 到circRNA微阵列芯片上,扫描得到两种细胞的circRNA表达谱;在Agilent Feature Extraction软件中进行原始数据提取,并对 采集到的阵列图像进行分位数归一化和后续数据处理,进行火山图和聚类热图分析;最后,选取差异表达倍数较高的3 条 circRNA进行实时荧光定量PCR(qPCR)鉴定。结果提取的MCF7和MCF10A细胞总RNA纯度高、完整度较好;扫描微阵列 芯片上标记的荧光信号,发现两种细胞的circRNA 表达谱明显不同;与MCF10A细胞相比,在MCF7 细胞的全部12 910 条 circRNA表达归一化结果中,有5964条上调,81条表达水平一致,6865条下调;表达差异(Log fold change)在2倍以上的有343 条,其中213 条上调,130 条下调;表达差异在5 倍以上的有9 条,其中8 条上调,分别为:hsa_circRNA_061260(6.02 倍)、 hsa_circRNA_103933(5.96倍)、hsa_circRNA_005239(5.84倍)、hsa_circRNA_100689(5.69倍)、hsa_circRNA_004087(5.60倍)、 hsa_circRNA_104420(5.25 倍)、hsa_circRNA_104421(5.13 倍)和hsa_circRNA_101222(5.03 倍),1 条下调:hsa_circRNA_ 104864(5.09倍);经qPCR鉴定hsa_circRNA_100689、hsa_circRNA_005239和hsa_circRNA_104864的差异表达趋势与芯片结 果相符。结论Luminal亚型乳腺癌细胞与正常乳腺细胞的circRNA表达差异较大,其中表达上调或下调的circRNA有望成为 Luminal亚型乳腺癌诊断的新靶标。