摘要: 目的分析人类与小鼠lncRNA中的同源与种系特异性lncRNA,揭示人类与小鼠表观遗传调控的种系差异。方法根据同 源lncRNA序列搜索和人类/小鼠全基因组双序列比对确定GENCODE项目首期报道的13562个人类lncRNA和10481个小鼠 lncRNA中的同源lncRNA基因,用lncRNA/DNA结合分析软件LongTarget预测lncRNA的DNA结合位点和表观遗传调控靶基 因,根据Gene Ontology 数据库分析靶基因的功能。结果仅158 对人类和小鼠lncRNA 被识别为同源lncRNA,这些同源 lncRNA在人类与小鼠基因组有种系特异性的DNA结合位点和靶基因,Gene Ontology分析提示这些同源lncRNA对靶基因的 种系特异性调控可能对人类和小鼠的表型差异有重要影响。结论仅极少数人类和小鼠lncRNA是同源的,这些同源lncRNA 有种系特异性的表观遗传调控靶基因,lncRNA和表观遗传调控的种系特异性对人类和小鼠的差异(包括疾病模型的差异)有重 要影响。