南方医科大学学报 ›› 2023, Vol. 43 ›› Issue (1): 8-16.doi: 10.12122/j.issn.1673-4254.2023.01.02
张攀扬,何明敏,曾园媛,蔡雄伟
ZHANG Panyang, HE Mingmin, ZENG Yuanyuan, CAI Xiongwei
摘要: 目的 探讨在高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)中的潜在功能性miRNA-mRNA调控网络与复发的相关性及其生物学意义。方法 使用来自癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)数据库的HGSOC患者样本表达数据,根据基因本体论生物过程(GO_BP)将HGSOC患者分成不同的亚型,分析不同亚型与复发的相关性;通过基因表达综合(GEO)数据库找到两个与复发相关的数据集,与TCGA数据取交集,获得共同差异表达的miRNAs;预测miRNAs的靶基因,构建与HGSOC复发相关的关键miRNA-mRNA网络;通过RT-qPCR及Western blot检测miR-506-3p与SNAI2的表达水平;双荧光素酶实验验证miR-506-3p与SNAI2的靶向结合;划痕实验及Trans well实验检测miR-506-3p对卵巢癌细胞迁移与侵袭的影响。结果 共筛选出与HGSOC相关通路活性的303个GO 通路,确定两个亚型C1和C2。亚型与复发相关,C1患者的复发概率显著高于C2患者。C1和C2亚型之间的差异表达基因主要富集在上皮间质转化(EMT)通路,GSE25204、GSE73582及TCGA 3个数据集中有5个共同差异表达的miRNAs,共有41个靶基因能在C1和C2亚型之间差异表达的EMT通路中找到,利用这5个miRNAs及41个mRNAs构建与HGSOC复发相关的关键miRNA-mRNA网络。MiR-506-3p与SNAI2靶向结合,上调miR-506-3p抑制了SNAI2表达及降低SKOV3和CAOV3的迁移及侵袭(P<0.05);而敲低miR-506-3p显著上调SNAI2表达水平及增强SKOV3和CAOV3的迁移及侵袭(P<0.05)。结论 miR-506-3p和SNAI2是与HGSOC复发相关的关键分子,miR-506-3p可能通过SNAI2调控卵巢癌细胞的迁移和侵袭影响EMT,对HGSOC的复发有预测价值。