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  南方医科大学学报  2015, Vol. 35Issue (5): 692-696  DOI: 10.3969/j.issn.1673-4254.2015.05.13.
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周学亮, 刘季春. Notch1胞内结构域慢病毒表达载体及干扰载体的构建[J]. 南方医科大学学报, 2015, 35(5): 692-696. DOI: 10.3969/j.issn.1673-4254.2015.05.13.
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ZHOU Xueliang, LIU Jichun. Construction of the N1ICD lentiviral over-expression and interference vectors[J]. Journal of Southern Medical University, 2015, 35(5): 692-696. DOI: 10.3969/j.issn.1673-4254.2015.05.13.
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基金项目

国家自然科学基金(81260024);江西省自然科学基金(20122BAB205026, 20132BAB205033)

作者简介

周学亮,博士,主治医师,E-mail: Dr_zhouxliang@163.com

通信作者

刘季春,博士,教授,主任医师,E-mail: Liujichun999@163.com

文章历史

收稿日期:2014-10-22
Notch1胞内结构域慢病毒表达载体及干扰载体的构建
周学亮, 刘季春     
南昌大学第一附属医院心血管外科,江西 南昌 330006
摘要: 目的 构建高滴度大鼠N1ICD慢病毒过表达载体(LV-N1ICD)及N1ICD慢病毒干扰载体(LV-N1ICD-shRNA)。 方法 以大鼠cDNA文库为模板,PCR法扩增N1ICD,通过定向克隆构建pGC-FU-N1ICD-3Flag穿梭质粒;设计4对N1ICD-shRNA寡核苷酸序列,以构建GVC112-N1ICD-shRNA干扰质粒,将pGC-FU-N1ICD-3Flag和GVC112-N1ICD-shRNA共转293T细胞,检测Flag的表达,筛选理想的GVC112-N1ICD-shRNA干扰质粒。将pGC-FU-N1ICD-3Flag或GVC112-N1ICD-shRNA与pHelper 1.0、pHelper 2.0共转293T细胞,以包装LV-N1ICD和LV-N1ICD-shRNA,分别利用Real-time PCR、药物筛选法进行病毒滴度测定。LV-N1ICD及LV-N1ICD-shRNA分别感染H9c2心肌细胞,利用CCK-8检测细胞活力。 结果 pGC-FU-N1ICD-3Flag和GVC112-N1ICD-shRNA质粒经PCR、基因测序及Western-blotting验证构建成功,与pHelper 1.0、pHelper 2.0共转293T细胞后,取上清浓缩,分别获得高滴度LV-N1ICD和LV-N1ICD-shRNA。LV-N1ICD可明显提高心肌细胞活力,LV-N1ICD-shRNA可降低心肌细胞活力。 结论 LV-N1ICD和LV-N1ICD-shRNA包装成功,具有Notch1信号通路生物学功能。
关键词: Notch信号通路    胞内结构域    慢病毒    质粒构建    RNA干扰    病毒包装    
Construction of the N1ICD lentiviral over-expression and interference vectors
ZHOU Xueliang, LIU Jichun     
Department of Cardiac Surgery, The First Affiliated Hospital, Nanchang University, Nanchang 330006, China
Supported by National Natural Science Foundation of China (81260024)
Abstract: Objective To construct rat N1ICD lentiviral over-expression vector (LV-N1ICD) and N1ICD lentivirus interference vector (LV-N1ICD-shRNA. Methods With the rat cDNA as a template, the N1ICD fragment was amplified by PCR to construct pGC-FU-N1ICD-3Flag shuttle plasmid by directly clone. Four pairs of N1ICD-shRNA oligonucleotide sequences were synthesized to construct the GVC112-N1ICD-shRNA interference plasmid. pGC-FU-N1ICD-3Flag and GVC112 -N1ICD-shRNA plasmids were co-transfected into 293T cells to screen for the best interference plasmid in the 4 GVC112-N1ICD-shRNA plasmids by detecting Flag expression. pGC-FU-N1ICD-3Flag or GVC112-N1ICD-shRNA plasmid along with with pHelper 1.0 and pHelper 2.0 plasmids were co-transfect into 293T cells to package LV-N1ICD and LV-N1ICD-shRNA, and the virus titer was determined by real-time PCR and drug screening method, respectively. H9c2 cells infected with LV-N1ICD and LVN1ICD-shRNA respectively were assessed for cell viability using CCK-8 assay. Results pGC-FU-N1ICD-3Flag and GVC112-N1ICD-shRNA plasmid were verified by PCR, gene sequencing and Western blotting. Co-transfection of the plasmids with pHelper 1.0, and pHelper 2.0 plasmids into 293T cells obtained high-titer LV-N1ICD and LV-N1ICD-shRNA. LV-N1ICD was capable of promoting the cell viability and LV-N1ICD-shRNA produced an opposite effect. Conclusion The vectors LV-N1ICD and LV-N1ICD-shRNA have been successfully constructed and packaged, which have the biological functions of Notch1 signaling.
Key words: notch signaling    intracellular domain    lentivirus    plasmid construction    RNA interference    virus packaging    

Notch信号通路为邻近细胞之间信息交流平台,激活后经二次裂解,释放Notch胞内结构域(Notch intracellular domain, NICD)进入细胞核,启动靶基因转录,发挥生物学效应[1]。研究发现Notch不仅调节胚胎期心脏的发育和分化[2],而且刺激未成熟心肌细胞的增殖[3],促进静止期心肌细胞重新进入细胞周期,有利于损伤心肌的再生修复[4]。最新研究发现Notch1信号通路的激活可加快心肌梗死后期心功能的恢复[5]。因此本研究将包装高滴度Notch1胞内结构域(Notch1 intracellular domain, N1ICD)慢病毒过表达载体(N1ICD lentiviral vector, LV-N1ICD)及N1ICD慢病毒干扰载体(N1ICD-shRNA lentiviral vector, LVN1ICD-shRNA),并研究其在H9c2心肌细胞中的生物学功能,为探讨Notch1信号通路在心肌保护作用奠定研究基础。

1 材料与方法 1.1 材料 1.1.1 细胞及菌株

293T细胞、H9c2心肌样细胞购于中科院上海生命科学院细胞库,DH5α化学感受态细胞购于Invitrogen。

1.1.2 大鼠cDNA文库及慢病毒载体系统

大鼠cDNA文库来购于TAKARA;pGC-FU-EGFP-3Flag Vector、GV112 Vector、pHelper 1.0 plasmid、pHelper 2.0 plasmid购于上海吉凯基因化学技术有限公司。

1.1.3 主要试剂

Taq DNA polymerase购于北京全式金生物技术有限公司,限制性核酸内切酶(AgeⅠ、NheⅠ、EcoRⅠ)购于New England Biolabs;T4 DNA Ligase购于TaKaRa,凝胶回收试剂盒及质粒小提试剂盒购于OMEGA,In-Fusion PCR Cloning Kit购于Clontech laboratories;LipofectamineTM 2000购于Invitrogen,细胞裂解液购于碧云天生物技术研究所,小鼠抗Flag单克隆抗体购于anbo,小鼠抗β-Actin单克隆抗体购于Cell signaling technology;辣根过氧化物酶标记山羊小鼠IgG均购于北京中杉金桥公司,化学发光试剂盒(SuperSignal West Pico Chemiluminescent Substrate)购自美国Pierce,CCK-8试剂盒购于Solarbio。

1.1.4 引物设计与合成

根据GeneBank中的大鼠Notch1基因编码序列(NCBI Reference Sequence: NM_001105721),Primer Premier 5.0设计N1ICD克隆引物并插入AgeⅠ与NheⅠ酶切位点(Forward Primer: 5'-GAGGATCCCCGGGTACCGGTCGCCACCATGG TGCTGCTGTCCCGCAAGC-3',Reverse Primer:5'-T CATCCTTGTAGTCGCTAGCCTTAAATGCCTCTGGAATG-3'),产物大小为2364 bp;设计N1ICD鉴定引物(Forward Primer: 5'-GTGCAGACCCAGCAGGT G-3', Reverse Primer: 5'-AGCGTA AAAGGAGCAAC ATAG-3'),产物大小为665 bp;设计LV-N1ICD Realtime PCR引物(Forward Primer: 5'-AATTCCGTGG TGTTGTCG-3',Reverse Primer: 5'-AAGGTCCGCTG GATTGAG-3'),产物大小为123 bp;设计GV112通用引物(Forward Primer: 5'-CCTATTTCCCATGATTCC TTCATA-3', Reverse Primer: 5'-GT AATACGGTTATC CACGCG-3'),产物大小542 bp;一起交Invitrogen公司合成,规格为2OD。

1.1.5 干扰片段设计与合成

针对大鼠Notch1基因,设计4对N1ICD-shRNA寡核苷酸序列(N1ICDshRNA-1: GCACAGTGCTGAGTACCAA;N1ICDshRNA-2: GCCTCTCC ACCAATACCTT;N1ICDshRNA-3: CCCACATTCCAGAGGCATT;N1ICDshRNA-4: TCTGGATGCCCGAATGCAT),分别插入AgeⅠ与EcoRⅠ酶切位点,交Invitrogen公司合成,规格为2OD。

1.2 方法 1.2.1 pGC-FU-N1ICD-3Flag重组质粒构建及鉴定

以大鼠cDNA文库为模板,PCR法获得N1ICD,经In-Fusion PCR Cloning Kit交换入pGC-FU-EGFP-3Flag Vector,转化DH5α感受态细胞,接种于氨苄青霉素(Amp+,100 μg/ml)的LB培养基平板,次日随机挑选阳性单克隆菌落,菌落PCR鉴定转化子,送基因测序,无突变的克隆命名为pGC-FU-N1ICD-3Flag重组质粒。利用LipofectamineTM 2000分2组(Control组:转染pGC-FU-EGFP-3Flag Vector、Overexpression组:转染pGC-FU-N1ICD-3Flag重组载体)转染293T细胞,48 h后提总蛋白,Western-blotting检测Flag及β-Actin表达。

1.2.2 GVC112-N1ICD-shRNA干扰质粒构建及筛选

将4对Oligonucleotide退火形成双链,T4 DNA Ligase连接AgeⅠ与EcoRⅠ双切酶后的双链Oligonucleotide、GVC112。将4组连接产物转化DH5α化学感受态细胞,接种于Amp+的LB培养基平板,次日随机挑选阳性单克隆菌落,使用GV112通用引物PCR鉴定阳性转化子,行基因测序,序列无误后分别命名为GVC112-N1ICD-shRNA-1、GVC112-N1ICD-shRNA-2、GVC112-N1ICD-shRNA-3、GVC112-N1ICD-shRNA-4。按LipofectamineTM 2000方法,分5组进行转染293T细胞,其中Control组为pGC-FU-N1ICD-3Flag+无义干扰质粒、N1ICD-shRNA-1组为pGC-FUN1ICD-3Flag + GVC112-N1ICD-shRNA-1、N1ICDshRNA-2组为pGC-FU-N1ICD-3Flag + GVC112-N1ICD-shRNA-2、N1ICD-shRNA-3组为pGC-FUN1ICD-3Flag + GVC112-N1ICD-shRNA-3、N1ICDshRNA-4组为pGC-FU-N1ICD-3Flag + GVC112-N1ICD-shRNA-4,48 h后提总蛋白,Western-blotting检测Flag及β-Actin表达。

1.2.3 N1ICD及N1ICD-shRNA慢病毒包装与浓缩

将pGC-FU-N1ICD-3Flag/GVC112-N1ICD-shRNA 20 μg、pHelper 1.0 15 μg、pHelper 2.0 10 μg共转293T细胞,48 h后,收集上清液,浓缩纯化,获得LV-N1ICD及LV-N1ICD-shRNA慢病毒载体,分别采用Real-time PCR及药物筛选法测定LV-N1ICD及LV-N1ICDshRNA滴度。

1.2.4 H9c2心肌细胞慢病毒感染

H9c2心肌细胞铺板,感染增强液(ENi.S)稀释病毒至20感染复数(MOI),去除半量DEME+10%FBS,加入稀释病毒,再加入5 μl/ml Ploybrene,混匀,孵育24 h后,更换DMEM+10% FBS,继续培养72 h。

1.2.5 细胞增殖检测

H9c2心肌细胞铺96孔板,每孔加入10 μl CCK-8溶液,CO2培养箱内继续孵育1.5 h,酶标仪测定450 nm吸光度。

2 结果 2.1 pGC-FU-N1ICD-3Flag重组质粒成功构建

N1ICD经PCR扩增后,1%琼脂糖凝胶电泳可见一条约2364 bp的特异条带(图 1A),与预计结果相符。将N1ICD插入pGC-FU-EGFP-3Flag Vector获得pGCFU-N1ICD-3Flag转化子,菌落PCR鉴定,1%琼脂糖凝胶电泳可见一条约665 bp的特异条带(图 1B),与预计结果相符。DNAMAN(Version 6.0.3.99)比对分析基因测序结果,与NlICD基因编码序列完全一致(图 1C)。将pGC-FU-N1ICD-3Flag质粒转染293T细胞,48 h后提总蛋白,Western-blotting显示Flag在Overexpression组表达,位置在89 000左右,提示pGC-FU-N1ICD-3Flag重组质粒构建成功,功能正常(图 1D)。

图 1 pGC-FU-N1ICD-3Flag重组质粒构建及鉴定 Figure 1 Construction and identification of recombinant plasmid of pGC-FU-N1ICD-3Flag: A: N1ICD gel electrophoresis imaging; B: pGC-FU-N1ICD-3Flag transformant colony PCR identification; C: The pGC-FU-N1ICD-3Flag recombinant plasmid of gene sequencing; D: The normal expression of pGC-FU-N1ICD-3Flag recombinant plasmid.
2.2 GVC112-N1ICD-shRNA干扰质粒成功构建及筛选

GVC112-N1ICD-shRNA阳性转化子菌落PCR鉴定,1%琼脂糖凝胶电泳可见一条约586 bp的特异条带,与预计结果相符(图 2A)。DNAMAN比对分析基因测序结果,与N1ICD-shRNA基因序列完全一致(图 2B~E)。将GVC112-N1ICD-shRNA干扰质粒与pGCFU-N1ICD-3Flag重组质粒共转293T细胞,48 h后提总蛋白,Western-blotting显示Flag在第4、5组表达最低,约为Mock组的90%,提示GVC112-N1ICD-shRNA-2、GVC112-N1ICD-shRNA-3可有效干扰N1ICD(图 2F)。本课题选取GVC112-N1ICD-shRNA-3作为后续实验研究。

图 2 GVC112-N1ICD-shRNA干扰质粒构建 Figure 2 Construction of GVC112-N1ICD-shRNA interference plasmids: A: GVC112-N1ICD-shRNA transformant colony PCR identification; B-E: GVC112-N1ICD-shRNA interference plasmid DNA sequencing; F: Screening of GVC112-N1ICD-shRNA interference plasmid.
2.3 LV-N1ICD、LV-N1ICD-shRNA滴度测定

利用Real-time PCR测定LV-N1ICD滴度,分析不同浓度病毒感染后样品组的Ct值及表达量(表 1),10-4 μl组和Con组样品间Ct值存在2个左右差异,认为在10-4 μl组样品中存在病毒颗粒。假定该组样品含有至少1个病毒颗粒,则LV-N1ICD滴度为:1/(1.00E-04)×20=2.00E+5TU/μl=2.00E+8TU/ml。

表 1 不同浓度病毒感染后样品组的Ct值及表达量分析 Table 1 Ct value and expression analysis of different concentrations of virus infection

因LV-N1ICD-shRNA带有Puromycin抗性,所以采用药筛法测定滴度,即通过感染后活细胞数量来判断滴度数值,其值等于带有活细胞数除以病毒原液量。在本实验中,加入1E-5 μl病毒原液的孔中观察到5个细胞存活,说明该孔中至少有5个病毒颗粒感染了细胞,则LV-N1ICD-shRNA滴度为:5(/ 1E-5)=5E+5TU/μl=5E+ 8TU/ml。

2.4 Notch1对心肌细胞增殖功能的影响

LV-N1ICD及LV-N1ICD-shRNA分别感染H9c2心肌细胞,利用CCK-8检测细胞活力。结果显示(图 3):LV-N1ICD可明显提高心肌细胞活力(P < 0.05),LV-N1ICD-shRNA可降低心肌细胞活力(P < 0.05),可见Notch1可改善心肌细胞增殖能力。

图 3 Notch1对心肌细胞活力的影响 Figure 3 Effect of Notch1 on myocardial cell viability. P < 0.05 vs LV-N1ICD; *P < 0.05 vs LV-N1ICDshRNA (n=3).
3 讨论

Notch信号通路无特异性激动剂,因此特异性激活Notch信号通路并非易事。利用Notch激动型抗体,虽然可以激活Notch信号通路,但特异性不佳[6]。Gude等[7]用50 ng/ml的HGF刺激大鼠心肌细胞,在HGF/c-Met/ Notch信号转导下间接激活Notch1,在5 min内可使Notch1及Hes1表达增加,效应可维持到6 h,但HGF仍不能直接激活Notch1。Notch信号通路抑制剂包括γ-secretase抑制剂、Notch受体及配体单克隆抑制型抗体,中药成分姜黄素等[8]。作为γ-secretase抑制剂,DAPT可以抑制Notch蛋白向NICD分裂的关键过程,能够非特异性阻断Notch信号通路的所有亚型,同样不适合Notch1信号通路的特异性研究[9]。因此利用基因异位表达和RNAi技术,针对特定Notch1蛋白构建相应表达载体,可达到特异性激活或抑制Notch1信号通路的作用。

Notch蛋白由胞外结构域和胞内结构域组成,胞外结构域由36个表皮生长因子样重复序列和3个半胱氨酸富集的LIN12/Notch重复序列组成,表皮生长因子样重复序列负责与Notch配体结合,LIN12/Notch预防Notch信号自身激活[10]。NICD含1个RAM23结构域、6个锚蛋白/cdc10重复序列、2个核定位序列、1个转录激活结构域、1个C末端富集脯氨酸、谷氨酸、丝氨酸、苏氨酸的PEST序列。Notch蛋白编码序列长达近7.6kb,全长难以完整克隆。由于Notch信号通路主要通过NICD发挥功能,因此对NICD的功能区进行选择性克隆,是近年Notch信号通路研究的主要手段之一[11]。但NICD在Notch蛋白编码序列上的功能定位各家报道不一,Tezuka K等利用RT-PCR技术获得小鼠cDNA文库,在Notch1 5428-6549位点定向克隆N1ICD,经验证具有Notch1蛋白的生物学功能[12]。由于国内外尚无大鼠N1ICD载体构建报道,因此我们选择Notch第二分裂位点(Gly1743和Val1744 [13])作为N1ICD基因克隆位点,经验证该片段具有Notch1蛋白的生物学效应。

目前,用于目的基因转移的的病毒载体主要包括腺病毒、腺相关病毒、逆转录病毒和慢病毒载体[14]。慢病毒载体是逆转录病毒的一个亚型,目前应用较多的来源于HIV-1的病毒载体,载体容量大,可感染非分裂期细胞,能在机体内持续表达。由于N1ICD片段较大,涉及细胞及动物实验,对病毒感染效率要求高,后续有可能需要构建N1ICD稳定表达细胞株,因此我们采用慢病毒载体系统构建N1ICD过表达及干扰载体。研究发现Notch1信号通路可刺激缺血心肌细胞增生,产生良好的心肌保护效应[7]。国内文献报道应用Notch信号通路阻断剂DAPT能抑制原代乳鼠心肌细胞增殖,促使心肌细胞发生凋亡[15],我们分别用LV-N1ICD及LV-N1ICDshRNA感染H9c2心肌细胞,发现Notch信号可提高心肌细胞活力,可见LV-N1ICD及LV-N1ICD-shRNA构建成功,并具有Notch信号的生物学功能,为将来Notch1信号通路在心肌保护中的功能与机制研究奠定了实验基础。

参考文献
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